Javier nació el 28 de septiembre de 1981 en la ciudad de Valparaíso. Su conversión al Señor ocurrió el 8 de noviembre del año 1998 a los 17 años.
Cursó sus estudios teológicos en el Seminario Teológico José Manuel Ibáñez Guzmán, licenciando el 2009.
Colaboró como licenciado en el área pastoral en la ciudad de Valparaíso y Viña del Mar durante el periodo de 2006-2011
Durante el 2012 y 2013 es invitado a participar como parte del equipo misionero de Cruzada de Literatura Cristiana como vendedor de literatura cristiana trabajando como encargado de la sección de referencia y estudio Bíblico.
El hno. Javier Allende es casado con Ernestina Cabaña desde febrero del 2007 y padre de dos niños: Javier Allende Cabaña y Leticia Allende Cabaña.
En la actualidad es miembro del Equipo Pastoral de la Iglesia Presbiteriana Cristo mi Pastor, Capellán del Colegio Presbiteriano el Salvador, y presbiterio en disposición. Actualmente cursa su magister en teología desde marzo del 2015 en el “Centro Latinoamericano de Estudios Reformados (CLER)”.